大佛寺始建于南汉时期（917—971年），初名新藏寺，元明时期多次更名。清康熙二年（1663年），平南王尚可喜为“天子祈福”重建寺院，因规模宏大，被誉为“岭南之冠”，遂定名“大佛寺”。鼎盛时占地三万余平方米，后因历史变迁，仅存大雄宝殿。

1986年，广州市政府批准开放大佛寺。1996年耀智法师出任住持后，经二十余年复建，于2023年完成寺院整体重建，恢复丛林格局。现建有毗卢殿、禅堂、图书馆、素食馆等现代化设施，以及观音殿、地藏殿、钟鼓楼等传统殿堂，总建筑面积三万余平方米，兼具礼佛、禅修、文化传播等功能。

大佛寺历史底蕴深厚，见证诸多重要事件：清代五世班禅曾在此举办法会；雍正帝下旨整顿广东佛教；林则徐设禁烟总局于此；孙中山题写“阐扬三密”保护寺产；周恩来在此举办革命训练班。如今，大佛寺不仅是佛教胜地，更是广州重要的历史文化地标。